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理學院以兩個不同的本科課程取代原有的理學課程（JS5100），分別是理學A組課程（JS5102）及理學B組課程（JS5103）。理學A組課程專為對物理科學感興趣的同學而設，而理學B組課程則專為對化學和生命科學感興趣的同學而設。理學院開設這兩個學院制課程的目的是為配合同學對選科的需要，旨在讓同學能夠按自己對理學科目的興趣和能力，盡早選定自己心儀的本科課程修讀。

而國際科研課程（JS5101）是一個專為有志於將來從事科研工作，並想及早在本科階段接觸研究的學生而設的專修選擇。國際科研課程有著與理學A組及B組課程相似的課程架構，但有別於一般理學課程，國際科研課程學生可以：

• 自由選擇入讀六個主修課程：生物化學及細胞生物學、生物科技、化學、數學、海洋科學與技術及物理

• 獲機會與諾貝爾獎得主及世界知名的科學家交流

• 獲得個人化研究指導及學習啓導

• 獲保證參加本科生研究計劃（UROP）

• 獲保證在海外交流的機會

  • 在海外頂尖大學或國家級實驗室參與暑期研究實習工作

  • 獲得獎學金資助海外學習費用

理學A組課程（JS5101）為對物理科學感興趣的同學而設。在完成第一學年後，理學A組的學生可以選擇相應的主修課程，或是申請修讀與延伸主修人工智能配搭的三個課程其中之一。

而對物理科學及人工智能皆有興趣的同學則可報讀理學A組 – 延伸主修人工智能課程（JS5181）。同學可在完成第一學年後，選擇以數學／物理／海洋科學與技術為主修，並以人工智能作為延伸主修。

額外的選修科目會作為申請人的額外資料，在同分的情況下列入考慮的因素。

理學院在計算入學分數時，理學A組課程、理學A組 – 延伸主修人工智能課程、理學B組課程及國際科硏課程只計算五科最佳的成績，而數學與經濟學課程（JS5813）及生物科技及商學課程（JS5811）則計算六科最佳的成績。因此，額外的選修科目只會在同分的情況下列入考慮的因素，或在計算入學分數時獲得額外加分。 

國際科研課程的學生可自由選擇入讀理學院所提供的六個主修課程；理學課程的學生，如在理科選修科目中獲得5**的成績，亦可獲保證入讀相應的主修課程。

申請人的學業成績是最主要的考慮因素。在其他領域有傑出表現的學生亦會獲優先考慮，例如：國際物理／數學奧林匹克競賽獎牌得主或香港代表隊成員。

經「大學聯合招生辦法」入學的申請人，理學院會考慮其整體的表現，包括：

• 學科表現；

• 比賽／活動的經驗及成就（OEA）；

• 額外選修科目；

• 面試表現（如適用）；

• 學生學習概覽（SLP）；

• 500字個人自述；

• 學校評估報告（學校成績表現、個人及一般能力）（SRR）

「比賽／活動的經驗及成就」、「學校評估報告」、「校長推薦計劃」及「學生學習概覽」會納入評估的考量中，並佔着一定比重。在「比賽／活動的經驗及成就」中列出的成績，例如：在國際比賽取得獎項，可能對遴選有幫助。取得某些獎項的學生將有機會獲得有條件錄取。大學主要會考慮來自組別A（Band A）的學生的「比賽／活動的經驗及成就」。

理學院會透過個人自述了解學生的性格、理想、選擇理學院課程的目的或適合性。一篇理想的個人自述應該擁有清晰的重點，顯示出申請人的熱誠及個性，同時表現出創意及獨立思考能力，使讀者閱畢後能對申請人留下深刻印象。 

得到「校長推薦計劃」推薦的組別A申請人會獲慎重考慮。假若申請人達到科大及理學院的最低入學要求，可能會獲得額外加分，或者獲給予有條件取錄。

理學院會參考學生的香港中學文憑考試成績及其他資料，包括：組別選擇、面試表現、「比賽／活動的經驗及成就」、「學校評估報告」及「學生學習概覽」，以作全面評估。

取得香港中學文憑考試及其他認可考試全科證書的學生可以透過「大學聯合招生辦法」或透過科大網上入學申請系統申請入學，但不能同時透過兩個途徑作出申請。