理学B组课程专为对自然科学感兴趣的同学而设。在第一个学年，学生会修读理学基础课程、语文、选修及／或通识教育课程。在完成首年课程后，理学院学生除可以选择由理学院所提供的主修专业之外，也可以选择学院合办专业或跨学科课程：
理学士（生物化学及细胞生物学）
理学士（生物科技）
理学士（生物医学及健康科学）
理学士（生物科技及商学）*
理学士（化学）
理学士（海洋科学与技术）
理学士（海洋科学与技术 — 数码媒体及创意艺术延伸主修）
理学士（环境管理及科技）#
跨学科自选主修课程#
科技及管理学双学位课程#
*学院合办专业 #由跨学科学院提供
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本科生课程简介2025（电子书版本）
理学院提供两个学院制入学课程：理学A组及理学B组。理学A组为对数理科学感兴趣的学生而设，而理学B组则专为对自然科学感兴趣的学生而设。
国际科研课程是专为将来有志于从事科研工作，并希望尽早在本科阶段接触研究的学生而设。课程着重培养学生好奇心和毅力，此乃成为杰出科研人员不可或缺的重要特质。此课程以理学课程为基础，加强学生专门的学术知识，并提早培养学生的研究能力。
国际科研课程有着与理学A组及B组课程相似的课程架构，并为学生提供以下的机会及支持：
大部份学生于毕业后到世界各地知名大学修读研究生课程。
透过在香港科技大学的学习，我看到了一个更大的世界，并在智能和心理上成长为更丰富的人...
