理學B組課程專為對化學和生命科學感興趣的同學而設。在第一個學年，學生會修讀理學基礎課程、語文、選修及 / 或通識教育課程。在完成首年課程後，理學院學生除可以選擇由理學院所提供的主修課程之外，也可以選擇學院合辦課程或跨學科課程：
理學士（生物化學及細胞生物學）
理學士（生物科技）
理學士（生物醫學及健康科學）*
理學士（化學）
理學士（海洋科學與技術）
理學士（海洋科學與技術）— 延伸主修數碼媒體及創意藝術
理學士（環境管理及科技）#
跨學科自選主修課程#
科技及管理學雙學位課程#
*學院合辦課程 #由跨學科學院提供
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由2020年起，理學院以兩個不同的本科課程取代原有的理學課程，分別是理學A組課程及理學B組課程。理學A組課程專為對物理科學感興趣的同學而設，而理學B組課程則專為對化學和生命科學感興趣的同學而設。理學院開設這兩個學院制課程的目的是為要配合同學對選科的需要，希望同學能夠按自己對理學科目的興趣和能力，盡早選定自己心儀的本科課程修讀。
而國際科研課程是一個專為有志於將來從事科研工作，並想及早在本科階段接觸研究的學生而設的專修選擇。國際科研課程有著與理學A組及B組課程相似的課程架構，但有別於一般理學課程，國際科研究學生可以：
自由選擇入讀六個主修課程：生物化學及細胞生物學、生物科技、化學、數學、海洋科學與技術及物理
參與量身定制的團隊建立活動和實地考察
獲得個人化研究指導及學習啓導
獲保證參加本科生研究計劃（UROP）
獲保證在海外交流的機會
在海外頂尖大學或國家級實驗室參與暑期研究實習工作
獲得獎學金資助海外學習費用
透過在香港科技大學的學習，我看到了一個更大的世界，並在智能和心理上成長為更豐富的人...
